苗種是水產養殖的關鍵 ，六種常見的淡水魚寄生蟲裏 ，其中四種非常喜歡魚種 、水花 。了解他們的習性是更好的消滅寄生蟲的第一步 。有效防治苗種寄生蟲也是水產養殖的第一步 。

纖毛蟲以細菌和有機碎屑為主要餌料,而有機質豐富的水域為纖毛蟲的生長和繁殖提供了足夠的食物來源 。纖毛蟲在所有水產養殖品種 、各個階段上都會發生 ，尤其河蟹與對蝦 。南方全年都在發生 ，7-11月為發病高峰期 。舊方法均是采用甲醛 、硫酸銅溶液等掛袋或外潑 ，禁用藥或重金屬藥物不值得推薦 。建議可以采用主要成分為青蒿的藥物 ，外潑預防 ，內服治療 ，3-7天 。

指環蟲均為卵生 ，卵大而少 ，在溫暖季節能不斷產卵 、孵化 。卵的發育與水溫有密切關係 。指環蟲固著盤的錨鉤和小鉤鉤在鰓組織上 ，剝取魚的鰓組織細胞和吸取血液為營養 。危害品種主要有 ，草魚 、鰱魚 、鱅魚 、鱸魚 、鱖魚 、羅非魚等 。春末夏初最易感染魚苗 。魚種放養前 ，必須進行仔細的浸泡 、消毒工作 。

孢子蟲在魚體寄生 、繁殖和形成胞囊 ，導致寄生組織器官的損傷 ，破壞其正常機能 ，引起相應的症狀 ，影響魚的生長發育 ，甚至死亡 。一般以寄生在鰓 、腸 、體表和神經係統的種類危害較大 。孢子蟲的繁殖時間在夜晚 ，因此用藥在下午5點前後最佳 。孢子蟲從卵到成蟲有5-7天的發育時間 ，預防用藥必須大於3天 ，治療時間必須大於7天以防止複發 。做好清塘後的底泥消毒工作 、購買良好品質不帶孢子的魚苗是預防孢子蟲病的基礎 。

車輪蟲寄生在鰓上的車輪蟲病是魚苗魚種階段危害較大的魚病之一 。全國各地都有流行 ，每年5～8月間 ，繁殖適宜水溫為20～28℃ ，魚苗 、夏花魚種常因此病而大批死亡 。經常用大草或糞肥漚水培育魚苗魚種的池塘 ，水質一般比較髒 ，也是車輪蟲病發生的主要場所 。日常養殖過程中 ，注意及時改底與消毒 ，尤其在陰雨天氣前必須提前預防 。多觀察魚體是否有“跑馬”現象 ，預防 、治療用藥常備 。

斜管蟲在全國各養殖地區都可出現 ，對飼養的淡水魚類的魚苗和魚種危害最大 ，往往造成極大的經濟損失 ，是一種發病快，來勢猛 ，危害大的幼魚階段的常見流行病 。該病的發生與水溫密切相關 ，斜管蟲最適繁殖水溫是12～18℃ ，初冬和春季最為流行 。

鰓隱鞭蟲主要危害魚苗 、夏花 ，大量寄生時可引起病魚大批死亡引起魚生病和造成大量死亡的主要是草魚苗種 ，尤其在草魚苗階段飼養密度大 、規格小 、體質弱 ，容易發生此病 。每年5～10月份流行 。冬春季節 ，鰓隱鞭蟲往往從草魚鰓絲轉移到鰱 、鱅鰓耙上寄生 ，但不能使鰱 、鱅發病 ，因鰱 、鱅魚有天然免疫力成為“保蟲寄主” 。同時 ，大魚對此蟲也有抵抗力 。

國家專家經過研究證明 ，中草藥——青蒿 ，對抑製淡水寄生蟲有極好的作用 ，內服亦或是外用 ，均可達到驅逐寄生的效果 ，保證治療濃度與用藥長度 ，即可有效殺死蟲體 。硫酸銅 、甲醛等消毒溶液雖高效 ，但易殺死魚體 ，或導致後期的用藥免疫 、甚至魚體畸形等 。看起來似乎好 ，實則傷己害人 。